Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KRTAP5-AS1-204ENST00000534077 409 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZNF17-202ENST00000595162 630 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFKBID-207ENST00000590094 751 ntTSL 318.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAF6L-202ENST00000524976 1061 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-221ENST00000476429 462 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 417.97■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 217.96■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-219ENST00000496586 567 ntTSL 317.88■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-211ENST00000636007 563 ntTSL 417.83■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 RNF4-204ENST00000503659 558 ntTSL 417.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCG1-211ENST00000490253 527 ntTSL 217.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-209ENST00000567291 1110 ntTSL 317.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-210ENST00000569610 611 ntTSL 417.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-206ENST00000590397 1083 ntTSL 517.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 217.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TIAL1-210ENST00000479729 485 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C5orf66-201ENST00000505828 561 ntTSL 417.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-208ENST00000436029 911 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 517.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-220ENST00000497386 1060 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-205ENST00000527779 842 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSF1-202ENST00000527328 2336 ntTSL 217.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-215ENST00000542785 633 ntTSL 417.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NCSTN-208ENST00000438008 702 ntTSL 517.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAF6L-207ENST00000532915 990 ntTSL 217.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAF6L-203ENST00000525405 594 ntTSL 517.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 517.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL1-233ENST00000640519 1970 ntTSL 317.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ITGA1-202ENST00000504086 1366 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-209ENST00000507784 582 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
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