Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKD2Q969F2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms