Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms