Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HERVK_113Q902F9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms