Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L4Q8WXT5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L4Q8WXT5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms