Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GATAD2BQ8WXI9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms