Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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COPS9Q8WXC6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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