Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMFBP1Q8TBY8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PMFBP1Q8TBY8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms