Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms