Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHCHD4Q8N4Q1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHCHD4Q8N4Q1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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