Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF28Q8N1W1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF28Q8N1W1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms