Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM50Q86XT4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms