Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF554Q86TJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF554Q86TJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms