Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUP54Q7Z3B4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP54Q7Z3B4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms