Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTF1AQ7RTS3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms