Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HS2ST1Q7LGA3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms