Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRINP3Q76B58 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRINP3Q76B58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms