Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP50Q70EL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP50Q70EL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP50Q70EL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP50Q70EL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP50Q70EL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP50Q70EL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms