Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYDE1Q6ZW31 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYDE1Q6ZW31 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms