Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms