Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms