Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMARCD3Q6STE5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCD3Q6STE5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms