Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED9Q6R2W3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms