Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDE2Q6IQ49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms