Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNS3Q68CZ2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNS3Q68CZ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms