Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms