Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GARNL3Q5VVW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GARNL3Q5VVW2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms