Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf53Q5VUE5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms