Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR78Q5VTH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms