Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GKAP1Q5VSY0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GKAP1Q5VSY0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms