Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC183Q5T5S1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms