Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PERM1Q5SV97 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PERM1Q5SV97 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms