Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHC1Q5JVL4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms