Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALFQ53S48 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALFQ53S48 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms