Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms