Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KRTAP21-3Q3LHN1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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