Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TYSND1Q2T9J0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms