Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIDA1Q1XH10 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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