Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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GEN1Q17RS7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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GEN1Q17RS7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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GEN1Q17RS7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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GEN1Q17RS7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GEN1Q17RS7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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