Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDO1Q16878 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDO1Q16878 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDO1Q16878 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDO1Q16878 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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