Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms