Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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