Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MEP1BQ16820 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MEP1BQ16820 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms