Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRF1Q16656 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms