Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms