Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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ECM1Q16610 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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ECM1Q16610 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM1Q16610 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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