Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRY1Q16526 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CRY1Q16526 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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CRY1Q16526 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CRY1Q16526 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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