Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRR4Q16378 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR4Q16378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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