Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS72Q15906 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS72Q15906 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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