Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6AP1Q15904 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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